IKZF1

Цинковый палец 1 (Ikaros) семейства IKAROS
Идентификаторы
Символ IKZF1 ; Hs.54452; IK1; IKAROS; LYF1; LyF-1; PPP1R92; PRO0758; ZNFN1A1
Внешние ID OMIM: 603023 MGI: 1342540 HomoloGene: 55948 GeneCards: Ген IKZF1
Функция • связывание с ДНК

• транскрипционный фактор, специфичный к последовательности ДНК
• специфичное к последовательности связывание с ДНК
• связывание ионов металлов

• гетеродимеризация белков
Компонент клетки • ядро

• центромерный гетерохроматин

• цитоплазма
Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промоторов РНК-полимеразы II

• дифференцировка натуральных киллеров
• ДНК-зависимая транскрипция
• клеточный цикл
• развитие мезодермы
• модификация хроматина
• дифференцировка В-клеток
• дифференцировка Т-клеток
• развитие переднего мозга
• положительная регуляция роста многоклеточного организма
• положительная регуляция дифференцировки нейтрофилов
• положительная регуляция транскрипции с промоторов РНК-полимеразы II
• развитие лимфоузлов
• развитие вилочковой железы
• развитие Пейеровых бляшек
• развитие желёз
• положительная регуляция дифференцировки натуральных киллеров

• развитие сетчатки в глазах камерного типа
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 10320 22778
Ensembl ENSG00000185811 ENSMUSG00000018654
UniProt Q13422 Q03267
RefSeq (мРНК) NM_001220765 NM_001025597
RefSeq (белок) NP_001207694 NP_001020768
Локус (UCSC) Chr 7:
50.34 – 50.47 Mb		 Chr 11:
11.69 – 11.77 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

ДНК-свя́зывающий бело́к Ика́рос, известный также как бело́к ци́нкового па́льца 1 семе́йства Ика́рос (англ. DNA-binding protein Ikaros, Ikaros family zinc finger protein 1, IKZF1) — белок, кодируемый у человека геном IKZF1[1][2][3].

Функции

Икарос выполняет важные функции в гемопоэтической системе, и потеря его функций связана с развитием лимфоидного лейкоза[4]. В частности, в последние годы было показано, что Икарос является одним из основных супрессоров опухоли, задействованных в развитии В-клеточного острого лимфобластного лейкоза у человека[4]. IKZF1 активируется в гранулоцитах, В-клетках, Т-клетках, несущих CD4- и CD8-рецепторы, NK-клетках и подавляется в эритробластах, мегакариоцитах и моноцитах[5]. У мышей, нокаутных по гену IKZF1, Т-клетки, но не B-клетки, всё-таки образуются на поздних этапах развития из-за поздней компенсационной экспрессии близкого гена Aiolos (IKZF3)[6]. Икарос приводит у мутантных мышей к смерти на стадии эмбрионе из-за анемии; у них наблюдаются серьёзные дефекты в терминальной дифференциации эритроцитов и гранулоцитов и чрезмерное образование макрофагов [7].

Клиническое значение

У людей однонуклеотидные полиморфизмы, расположенные вблизи 3'-участка гена IKZF1, были связаны с восприимчивостью к острому лимфобластному лейкозу (ОЛЛ) у детей[8], а также сахарному диабету типа 1[9]. Эти два эффекта, как представляется, противоположно направлены, то есть аллель, ответственный за восприимчивость к ОЛЛ, обеспечивает защиту от сахарного диабета 1-го типа, и наоборот[9].

Взаимодействия с другими белками

IKZF1, как было выявлено, взаимодействует с: IKZF2[англ.][10], IKZF3[англ.][11][12][13], IKZF4[англ.][14][15], гистондеацетилазой 5[16], HDAC1[17][16], HDAC7A[англ.][16], SIN3B[12][16], SIN3A[12][16][18] и CTBP1[19].

Примечания

  1. ↑ Georgopoulos K., Moore D.D., Derfler B. Ikaros, an early lymphoid-specific transcription factor and a putative mediator for T cell commitment (англ.) // Science : journal. — 1992. — December (vol. 258, no. 5083). — P. 808—812. — doi:10.1126/science.1439790. — PMID 1439790.
  2. ↑ Hahm K., Ernst P., Lo K., Kim G.S., Turck C., Smale S.T. The lymphoid transcription factor LyF-1 is encoded by specific, alternatively spliced mRNAs derived from the Ikaros gene (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1994. — November (vol. 14, no. 11). — P. 7111—7123. — PMID 7935426. — PMC 359245.
  3. ↑ Entrez Gene: IKZF1 IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros)  (неопр.).
  4. ↑ 1 2 Kastner P., Chan S. Role of Ikaros in T-cell acute lymphoblastic leukemia (англ.) // World J Biol Chem : journal. — 2011. — June (vol. 2, no. 6). — P. 108—114. — doi:10.4331/wjbc.v2.i6.108. — PMID 21765975. — PMC 3135856.
  5. ↑ Watkins N.A., Gusnanto A., de Bono B., De S., Miranda-Saavedra D., Hardie D.L., Angenent W.G., Attwood A.P., Ellis P.D., Erber W., Foad N.S., Garner S.F., Isacke C.M., Jolley J., Koch K., Macaulay I.C., Morley S.L., Rendon A., Rice K.M., Taylor N., Thijssen-Timmer D.C., Tijssen M.R., van der Schoot C.E., Wernisch L., Winzer T., Dudbridge F., Buckley C.D., Langford C.F., Teichmann S., Göttgens B., Ouwehand WH; Bloodomics Consortium. A HaemAtlas: characterizing gene expression in differentiated human blood cells (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2009. — May (vol. 113, no. 19). — P. e1—9. — doi:10.1182/blood-2008-06-162958. — PMID 19228925. — PMC 2680378.
  6. ↑ Georgopoulos K., Winandy S., Avitahl N. The role of the Ikaros gene in lymphocyte development and homeostasis. (англ.) // Ann Rev Immunol. : journal. — 1997. — Vol. 15. — P. 155—176. — doi:10.1146/annurev.immunol.15.1.155. — PMID 9143685.
  7. ↑ Papathanasiou P., Perkins A.C., Cobb B.S., Ferrini R., Sridharan R., Hoyne G.F., Nelms K.A., Smale S.T., Goodnow CC. Widespread failure of hematolymphoid differentiation caused by a recessive niche-filling allele of the Ikaros transcription factor (англ.) // Immunity : journal. — 2003. — July (vol. 19, no. 1). — P. 131—144. — doi:10.1016/s1074-7613(03)00168-7.
  8. ↑ Papaemmanuil E., Hosking F.J., Vijayakrishnan J., Price A., Olver B., Sheridan E., Kinsey S.E., Lightfoot T., Roman E., Irving J.A., Allan J.M., Tomlinson I.P., Taylor M., Greaves M., Houlston RS. Loci on 7p12.2, 10q21.2 and 14q11.2 are associated with risk of childhood acute lymphoblastic leukemia. (англ.) // Ann Rev Immunol. : journal. — 2009. — September (vol. 41, no. 9). — P. 1006—1010. — doi:10.1038/ng.430. — PMID 19684604.
  9. ↑ 1 2 Swafford A.D., Howson J.M., Davison L.J., Wallace C., Smyth D.J., Schuilenburg H., Maisuria-Armer M., Mistry T., Lenardo M.J., Todd JA. An allele of IKZF1 (Ikaros) conferring susceptibility to childhood acute lymphoblastic leukemia protects against type 1 diabetes. (англ.) // Diabetes : journal. — 2011. — February (vol. 60, no. 3). — P. 1041—1044. — doi:10.2337/db10-0446. — PMID 21270240. — PMC 3046822.
  10. ↑ Kelley C.M., Ikeda T., Koipally J., Avitahl N., Wu L., Georgopoulos K., Morgan BA. Helios, a novel dimerization partner of Ikaros expressed in the earliest hematopoietic progenitors (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — April (vol. 8, no. 9). — P. 508—915. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70202-7. — PMID 9560339.
  11. ↑ Morgan B., Sun L., Avitahl N., Andrikopoulos K., Ikeda T., Gonzales E., Wu P., Neben S., Georgopoulos K. Aiolos, a lymphoid restricted transcription factor that interacts with Ikaros to regulate lymphocyte differentiation. (англ.) // EMBO : journal. — 1997. — April (vol. 16, no. 8). — P. 2004—2013. — doi:10.1093/emboj/16.8.2004. — PMID 9155026. — PMC 1169803.
  12. ↑ 1 2 3 Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes. (англ.) // EMBO : journal. — 1999. — June (vol. 18, no. 11). — P. 3090—3100. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  13. ↑ Kim J., Sif S., Jones B., Jackson A., Koipally J., Heller E., Winandy S., Viel A., Sawyer A., Ikeda T., Kingston R., Georgopoulos K. Ikaros DNA-binding proteins direct formation of chromatin remodeling complexes in lymphocytes. (англ.) // Immunity : journal. — 1999. — March (vol. 10, no. 3). — P. 345—355. — doi:10.1016/S1074-7613(00)80034-5. — PMID 10204490.
  14. ↑ Honma, Y; Kiyosawa H., Mori T., Oguri A., Nikaido T., Kanazawa K., Tojo M., Takeda J., Tanno Y., Yokoya S., Kawabata I., Ikeda H., Wanaka A. Eos: a novel member of the Ikaros gene family expressed predominantly in the developing nervous system (англ.) // FEBS Letters[англ.] : journal. — NETHERLANDS, 1999. — March (vol. 447, no. 1). — P. 76—80. — ISSN 0014-5793. — doi:10.1016/S0014-5793(99)00265-3. — PMID 10218586.
  15. ↑ Perdomo, J; Holmes M; Chong B; Crossley M. Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 2000. — December (vol. 275, no. 49). — P. 38347—38354. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M005457200. — PMID 10978333.
  16. ↑ 1 2 3 4 5 Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27697—27705. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.
  17. ↑ Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // The EMBO Journal : journal. — ENGLAND, 1999. — June (vol. 18, no. 11). — P. 3090—3100. — ISSN 0261-4189. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  18. ↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. Ikaros-CtIP interactions do not require C-terminal binding protein and participate in a deacetylase-independent mode of repression (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — June (vol. 277, no. 26). — P. 23143—23149. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M202079200. — PMID 11959865.
  19. ↑ Koipally, J; Georgopoulos K. Ikaros interactions with CtBP reveal a repression mechanism that is independent of histone deacetylase activity (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 2000. — June (vol. 275, no. 26). — P. 19594—19602. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M000254200. — PMID 10766745.

Литература

  • Tonnelle C; Calmels B; Maroc C; Gabert, Jean; Chabannon, Christian. Ikaros gene expression and leukemia (англ.) // Leukemia & Lymphoma[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 43, no. 1. — P. 29—35. — doi:10.1080/10428190210186. — PMID 11908734.
  • Westman B.J., Mackay J.P., Gell D. Ikaros: a key regulator of haematopoiesis (англ.) // International Journal of Biochemistry & Cell Biology[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 34, no. 10. — P. 1304—1307. — doi:10.1016/S1357-2725(02)00070-5. — PMID 12127581.
  • Molnár A; Wu P; Largespada DA; Vortkamp, A; Scherer, S; Copeland, NG; Jenkins, NA; Bruns, G; Georgopoulos, K. The Ikaros gene encodes a family of lymphocyte-restricted zinc finger DNA binding proteins, highly conserved in human and mouse (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 156, no. 2. — P. 585—592. — PMID 8543809.
  • Nietfeld W., Meyerhans A. Cloning and sequencing of hIk-1, a cDNA encoding a human homologue of mouse Ikaros/LyF-1 (англ.) // Immunology Letters[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 49, no. 1—2. — P. 139—141. — doi:10.1016/0165-2478(95)02479-4. — PMID 8964602.
  • Morgan B; Sun L; Avitahl N; Andrikopoulos, K; Ikeda, T; Gonzales, E; Wu, P; Neben, S; Georgopoulos, K. Aiolos, a lymphoid restricted transcription factor that interacts with Ikaros to regulate lymphocyte differentiation (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1997. — Vol. 16, no. 8. — P. 2004—2013. — doi:10.1093/emboj/16.8.2004. — PMID 9155026. — PMC 1169803.
  • Kelley CM; Ikeda T; Koipally J; Avitahl, Nicole; Wu, Li; Georgopoulos, Katia; Morgan, Bruce A. Helios, a novel dimerization partner of Ikaros expressed in the earliest hematopoietic progenitors (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 8, no. 9. — P. 508—515. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70202-7. — PMID 9560339.
  • Sun L; Heerema N; Crotty L; Wu, X; Navara, C; Vassilev, A; Sensel, M; Reaman, GH; Uckun, F.M. Expression of dominant-negative and mutant isoforms of the antileukemic transcription factor Ikaros in infant acute lymphoblastic leukemia (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96, no. 2. — P. 680—685. — doi:10.1073/pnas.96.2.680. — PMID 9892693. — PMC 15196.
  • Kim J; Sif S; Jones B; Jackson, Audrey; Koipally, Joseph; Heller, Elizabeth; Winandy, Susan; Viel, Alain; Sawyer, Alan. Ikaros DNA-binding proteins direct formation of chromatin remodeling complexes in lymphocytes (англ.) // Immunity : journal. — 1999. — Vol. 10, no. 3. — P. 345—355. — doi:10.1016/S1074-7613(00)80034-5. — PMID 10204490.
  • Honma Y; Kiyosawa H; Mori T; Oguri, A; Nikaido, T; Kanazawa, K; Tojo, M; Takeda, J; Tanno, Y. Eos: a novel member of the Ikaros gene family expressed predominantly in the developing nervous system (англ.) // FEBS Letters[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 447, no. 1. — P. 76—80. — doi:10.1016/S0014-5793(99)00265-3. — PMID 10218586.
  • Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 11. — P. 3090—3100. — doi:10.1093/emboj/18.11.3090. — PMID 10357820. — PMC 1171390.
  • Sun L; Goodman PA; Wood CM; Crotty, ML; Sensel, M; Sather, H; Navara, C; Nachman, J; Steinherz, P.G. Expression of aberrantly spliced oncogenic ikaros isoforms in childhood acute lymphoblastic leukemia (англ.) // Journal of Clinical Oncology[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 17, no. 12. — P. 3753—3766. — PMID 10577847.
  • Hosokawa Y; Maeda Y; Ichinohasama R; Miura, I; Taniwaki, M; Seto, M. The Ikaros gene, a central regulator of lymphoid differentiation, fuses to the BCL6 gene as a result of t(3;7)(q27;p12) translocation in a patient with diffuse large B-cell lymphoma (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2000. — Vol. 95, no. 8. — P. 2719—2721. — PMID 10753856.
  • Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros interactions with CtBP reveal a repression mechanism that is independent of histone deacetylase activity (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 26. — P. 19594—19602. — doi:10.1074/jbc.M000254200. — PMID 10766745.
  • Perdomo J., Holmes M., Chong B., Crossley M. Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 275, no. 49. — P. 38347—38354. — doi:10.1074/jbc.M005457200. — PMID 10978333.
  • Payne KJ; Nicolas JH; Zhu JY; Barsky, LW; Crooks, G.M. Cutting edge: predominant expression of a novel Ikaros isoform in normal human hemopoiesis (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 167, no. 4. — P. 1867—1870. — doi:10.4049/jimmunol.167.4.1867. — PMID 11489963.
  • Koipally J., Heller E.J., Seavitt J.R., Georgopoulos K. Unconventional potentiation of gene expression by Ikaros (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 15. — P. 13007—13015. — doi:10.1074/jbc.M111371200. — PMID 11799125.
  • Dorsam G., Goetzl E.J. Vasoactive intestinal peptide receptor-1 (VPAC-1) is a novel gene target of the hemolymphopoietic transcription factor Ikaros (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 16. — P. 13488—13493. — doi:10.1074/jbc.M107922200. — PMID 11812772.