HNF4A

Ядерный фактор гепатоцитов 4-альфа
PDB прорисовано на основе 1m7w.PDB прорисовано на основе 1m7w.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1PZL, 3CBB, 3FS1, 4B7W, 4IQR

Идентификаторы
Символ HNF4A ; HNF4; HNF4a7; HNF4a8; HNF4a9; HNF4alpha; MODY; MODY1; NR2A1; NR2A21; TCF; TCF14
Внешние ID OMIM: 600281 MGI: 109128 HomoloGene: 395 IUPHAR: NR2A1 ChEMBL: 5398 GeneCards: Ген HNF4A
Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in positive regulation of transcription

• RNA polymerase II activating transcription factor binding
• DNA binding
• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• steroid hormone receptor activity
• ligand-activated sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription factor activity
• receptor binding
• fatty acid binding
• protein binding
• zinc ion binding
• protein homodimerization activity
• sequence-specific DNA binding

• transcription regulatory region DNA binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm

• cytoplasm
Биологический процесс • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• ornithine metabolic process
• lipid metabolic process
• xenobiotic metabolic process
• sex differentiation
• blood coagulation
• negative regulation of cell proliferation
• response to glucose
• gene expression
• regulation of gastrulation
• regulation of lipid metabolic process
• signal transduction involved in regulation of gene expression
• negative regulation of cell growth
• intracellular receptor signaling pathway
• endocrine pancreas development
• glucose homeostasis
• steroid hormone mediated signaling pathway
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• regulation of insulin secretion
• lipid homeostasis
• phospholipid homeostasis
• SMAD protein signal transduction
• regulation of growth hormone receptor signaling pathway
• triglyceride homeostasis

• positive regulation of cholesterol homeostasis
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 3172 15378
Ensembl ENSG00000101076 ENSMUSG00000017950
UniProt P41235 P49698
RefSeq (мРНК) NM_000457 NM_008261
RefSeq (белок) NP_000448 NP_032287
Локус (UCSC) Chr 20:
42.98 – 43.06 Mb		 Chr 2:
163.51 – 163.57 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ядерный фактор гепатоцитов 4-альфа, в международной номенклатуре известный как NR2A1  — ядерный рецептор, у человека кодирующийся геном HNF4A.

Функции

NHF4A — ядерный фактор транскрипции, в виде гомодимера связывающийся с ДНК. Данный белок контролирует экспрессию нескольких генов, в том числе ядерного фактора гепатоцитов 1-альфа (транскрипционного фактора, регулирующего экспрессию нескольких генов печени). Ген NHF4A играет важную роль в развитии печени и почек. В результате альтернативного сплайсинга образуется несколько вариантов транскриптов данного гена, кодирующих несколько изоформ белка, соответственно.

Клиническое значение

Мутации в гене NHF4A являются причиной сахарного диабета взрослого типа у молодых (MODY-диабета) и hnf4a-опосредованного гиперинсулинизма.

Алкалоид берберин повышает экспрессию гена HNF4A.

Взаимодействие гена

Ядерный фактор гепатоцитов 4-альфа взаимодействует со следующими биомолекулами:

  • Бета-катенин
  • Связывающий белок CREB
  • MED1
  • MED14
  • Малый гетеродимерный белок
  • Тестикулярный рецептор 4

Литература

  • Winter W.E., Nakamura M., House D.V. Monogenic diabetes mellitus in youth. The MODY syndromes (англ.) // Endocrinol. Metab. Clin. North Am. : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 4. — P. 765—785. — doi:10.1016/S0889-8529(05)70101-8. — PMID 10609119.
  • Zannis VI; Kan HY; Kritis A; Zanni, E; Kardassis, D. Transcriptional regulation of the human apolipoprotein genes (англ.) // Frontiers in Bioscience[англ.] : journal. — Frontiers in Bioscience[англ.], 2001. — Vol. 6. — P. D456—504. — doi:10.2741/Zannis. — PMID 11229886.
  • Gupta R.K., Kaestner K.H. HNF-4alpha: from MODY to late-onset type 2 diabetes (англ.) // Trends in molecular medicine[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 10, no. 11. — P. 521—524. — doi:10.1016/j.molmed.2004.09.004. — PMID 15519277.
  • Mohlke K.L., Boehnke M. The role of HNF4A variants in the risk of type 2 diabetes (англ.) // Curr. Diab. Rep.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 5, no. 2. — P. 149—156. — doi:10.1007/s11892-005-0043-y. — PMID 15794920.
  • Love-Gregory L., Permutt M.A. HNF4A genetic variants: role in diabetes (неопр.) // Current opinion in clinical nutrition and metabolic care. — 2007. — Т. 10, № 4. — С. 397—402. — doi:10.1097/MCO.0b013e3281e3888d. — PMID 17563455.
  • Bell GI; Xiang KS; Newman MV; Wu, SH; Wright, LG; Fajans, SS; Spielman, RS; Cox, N.J. Gene for non-insulin-dependent diabetes mellitus (maturity-onset diabetes of the young subtype) is linked to DNA polymorphism on human chromosome 20q (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1991. — Vol. 88, no. 4. — P. 1484—1488. — doi:10.1073/pnas.88.4.1484. — PMID 1899928. — PMC 51043.
  • Ktistaki E., Ktistakis N.T., Papadogeorgaki E., Talianidis I. Recruitment of hepatocyte nuclear factor 4 into specific intranuclear compartments depends on tyrosine phosphorylation that affects its DNA-binding and transactivation potential (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 21. — P. 9876—9880. — doi:10.1073/pnas.92.21.9876. — PMID 7568236. — PMC 40905.
  • Ginsburg G.S., Ozer J., Karathanasis S.K. Intestinal apolipoprotein AI gene transcription is regulated by multiple distinct DNA elements and is synergistically activated by the orphan nuclear receptor, hepatocyte nuclear factor 4 (англ.) // J. Clin. Invest.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 96, no. 1. — P. 528—538. — doi:10.1172/JCI118065. — PMID 7615825. — PMC 185227.
  • Jiang G., Nepomuceno L., Hopkins K., Sladek F.M. Exclusive homodimerization of the orphan receptor hepatocyte nuclear factor 4 defines a new subclass of nuclear receptors (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1995. — Vol. 15, no. 9. — P. 5131—5143. — PMID 7651430. — PMC 230760.
  • Chartier FL; Bossu JP; Laudet V; Fruchart, Jean-Charles; Laine, Bernard. Cloning and sequencing of cDNAs encoding the human hepatocyte nuclear factor 4 indicate the presence of two isoforms in human liver (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 147, no. 2. — P. 269—272. — doi:10.1016/0378-1119(94)90079-5. — PMID 7926813.
  • Drewes T., Senkel S., Holewa B., Ryffel G.U. Human hepatocyte nuclear factor 4 isoforms are encoded by distinct and differentially expressed genes (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 3. — P. 925—931. — PMID 8622695. — PMC 231074.
  • Yamagata K; Furuta H; Oda N; Kaisaki, Pamela J.; Menzel, Stephan; Cox, Nancy J.; Fajans, Stefan S.; Signorini, Stefano; Stoffel, Markus. Mutations in the hepatocyte nuclear factor-4alpha gene in maturity-onset diabetes of the young (MODY1) (англ.) // Nature : journal. — 1997. — Vol. 384, no. 6608. — P. 458—460. — doi:10.1038/384458a0. — PMID 8945471.
  • Kritis AA; Argyrokastritis A; Moschonas NK; Power, Susan; Katrakili, Nitsa; Zannis, Vassilis I.; Cereghini, Silvia; Talianidis, Lannis. Isolation and characterization of a third isoform of human hepatocyte nuclear factor 4 (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1996. — Vol. 173, no. 2. — P. 275—280. — doi:10.1016/0378-1119(96)00183-7. — PMID 8964514.
  • Argyrokastritis A; Kamakari S; Kapsetaki M; Kritis, Aristidis; Talianidis, Iannis; Moschonas, N. K. Human hepatocyte nuclear factor-4 (hHNF-4) gene maps to 20q12-q13.1 between PLCG1 and D20S17 (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1997. — Vol. 99, no. 2. — P. 233—236. — doi:10.1007/s004390050345. — PMID 9048927.
  • Thénot S., Henriquet C., Rochefort H., Cavaillès V. Differential interaction of nuclear receptors with the putative human transcriptional coactivator hTIF1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 18. — P. 12062—12068. — doi:10.1074/jbc.272.18.12062. — PMID 9115274.
  • Bulman MP; Dronsfield MJ; Frayling T; Appleton, M.; Bain, S. C.; Ellard, S.; Hattersley, A. T. A missense mutation in the hepatocyte nuclear factor 4 alpha gene in a UK pedigree with maturity-onset diabetes of the young (англ.) // Diabetologia[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 40, no. 7. — P. 859—862. — doi:10.1007/s001250050760. — PMID 9243109.
  • Møller AM; Urhammer SA; Dalgaard LT; Reneland, R.; Berglund, L.; Hansen, T.; Clausen, J. O.; Lithell, H.; Pedersen, O. Studies of the genetic variability of the coding region of the hepatocyte nuclear factor-4alpha in Caucasians with maturity onset NIDDM (англ.) // Diabetologia[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 40, no. 8. — P. 980—983. — doi:10.1007/s001250050778. — PMID 9267996.
  • Lindner T; Gragnoli C; Furuta H; Cockburn, B N; Petzold, C; Rietzsch, H; Weiss, U; Schulze, J; Bell, G I. Hepatic function in a family with a nonsense mutation (R154X) in the hepatocyte nuclear factor-4alpha/MODY1 gene (англ.) // J. Clin. Invest.[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 100, no. 6. — P. 1400—1405. — doi:10.1172/JCI119660. — PMID 9294105. — PMC 508318.
  • Furuta H; Iwasaki N; Oda N; Hinokio, Y.; Horikawa, Y.; Yamagata, K.; Yano, N.; Sugahiro, J.; Ogata, M. Organization and partial sequence of the hepatocyte nuclear factor-4 alpha/MODY1 gene and identification of a missense mutation, R127W, in a Japanese family with MODY (англ.) // Diabetes : journal. — 1997. — Vol. 46, no. 10. — P. 1652—1657. — doi:10.2337/diabetes.46.10.1652. — PMID 9313765.
  • Stoffel M., Duncan S.A. The maturity-onset diabetes of the young (MODY1) transcription factor HNF4α regulates expression of genes required for glucose transport and metabolism (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 94, no. 24. — P. 13209—13214. — doi:10.1073/pnas.94.24.13209. — PMID 9371825. — PMC 24288.