GRIN2B

GRIN2B
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

5EWM, 5EWL, 5EWJ

Идентификаторы
ПсевдонимыGRIN2B, GluN2B, MRD6, NMDAR2B, NR2B, hNR3, EIEE27, glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B, NR3, DEE27
Внешние IDOMIM: 138252 MGI: 95821 HomoloGene: 646 GeneCards: GRIN2B
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме GRIN2B
Расположение в геноме GRIN2B
Локус12p13.1Начало13,437,942 bp[1]
Конец13,982,002 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме GRIN2B
Расположение в геноме GRIN2B
Локус6 G1|6 66.38 cMНачало135,690,231 bp[2]
Конец136,150,509 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • buccal mucosa cell

  • цитоархитектоническое поле Бродмана 23

  • sural nerve

  • middle temporal gyrus

  • primary visual cortex
Наибольшая экспрессия в
  • lateral septal nucleus

  • olfactory tubercle

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • anterior amygdaloid area

  • seminiferous tubule

  • primary visual cortex
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • zinc ion binding
  • glycine binding
  • связывание с ионом металла
  • ion channel activity
  • связывание с белками плазмы
  • ionotropic glutamate receptor activity
  • extracellularly glutamate-gated ion channel activity
  • NMDA glutamate receptor activity
  • glutamate binding
  • glutamate-gated calcium ion channel activity
  • amyloid-beta binding
  • signaling receptor activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • postsynaptic membrane
  • мембрана
  • синапс
  • NMDA selective glutamate receptor complex
  • поверхность клетки
  • межклеточные контакты
  • neuron projection
  • внутренний компонент клетки
  • часть клеточной мембраны
  • постсинаптическое уплотнение
  • клеточная мембрана
  • цитоплазма
  • synaptic membrane
  • postsynaptic density membrane
Биологический процесс
  • glutamate receptor signaling pathway
  • ephrin receptor signaling pathway
  • ion transport
  • MAPK cascade
  • обучение или память
  • response to ethanol
  • chemical synaptic transmission
  • ionotropic glutamate receptor signaling pathway
  • возбуждающий постсинаптический потенциал
  • regulation of ion transmembrane transport
  • перенос
  • calcium-mediated signaling
  • protein heterotetramerization
  • regulation of molecular function
  • calcium ion transmembrane import into cytosol
  • multicellular organism development
  • развитие мозга
  • regulation of synaptic plasticity
  • долговременная потенциация
  • excitatory chemical synaptic transmission
  • positive regulation of neuron death
  • negative regulation of dendritic spine maintenance
  • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity
  • regulation of NMDA receptor activity
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

2904

14812

Ensembl

ENSG00000273079

ENSMUSG00000030209

UniProt

Q13224

Q01097

RefSeq (мРНК)

NM_000834

NM_008171
NM_001363750

RefSeq (белок)

NP_000825

NP_032197
NP_001350679

Локус (UCSC)Chr 12: 13.44 – 13.98 MbChr 6: 135.69 – 136.15 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

GRIN2B (англ. Glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2B) — ген, кодирующий NR2B-субъединицу глутаматного NMDA-рецептора. Наряду с NR2B, в сборке рецептора участвуют субъединицы других подтипов.

Клиническое значение

В ходе нескольких исследований отмечена возможная связь вариаций гена GRIN2B с развитием шизофрении[5].

Субъединица NR2B участвует в механизмах и памяти, и хронической боли[6].

Предполагается возможная роль NR2B-антагонистов в терапии алкоголизма[7][8].

Антитела к NR2B и другим субъединицам рецептора вызывают анти-NMDA-рецепторный энцефалит, заболевание, открытое в 2007 году.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000273079 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030209 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Gene Overview of All Published Schizophrenia-Association Studies for GRIN2B Архивировано 13 сентября 2010 года. (англ.) — «Обзор всех опубликованных работ по ассоциации GRIN2B с шизофренией», генетическая база данных SZGene, сайт Schizophrenia Research Forum.
  6. Zhuo M. Plasticity of NMDA receptor NR2B subunit in memory and chronic pain (англ.) // Mol Brain[англ.] : journal. — 2009. — Vol. 2, no. 1. — P. 4. — doi:10.1186/1756-6606-2-4. — PMID 19192303. — PMC 2644299. Архивировано 1 марта 2012 года.
  7. Nagy J. The NR2B subtype of NMDA receptor: a potential target for the treatment of alcohol dependence (англ.) // Curr Drug Targets CNS Neurol Disord : journal. — 2004. — June (vol. 3, no. 3). — P. 169—179. — PMID 15180478.
  8. Nagy J., Kolok S., Boros A., Dezso P. Role of Altered Structure and Function of NMDA Receptors in Development of Alcohol Dependence (англ.) // Curr Neuropharmacol : journal. — 2005. — October (vol. 3, no. 4). — P. 281—297. — PMID 18369402. — PMC 2268999.