ARNT |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/83/Protein_ARNT_PDB_1x0o.png/250px-Protein_ARNT_PDB_1x0o.png) |
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator |
---|
Внешние ID | OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![3-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/08/Ideogram_house_mouse_chromosome_3.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_3.svg.png) | Хр. | 3-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 3 F2.1|3 40.74 cM | Начало | 95,341,699 bp[2] |
---|
Конец | 95,404,551 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - epithelium of colon
- sural nerve
- stromal cell of endometrium
- ectocervix
- body of uterus
|
| Наибольшая экспрессия в | - muscle of thigh
- cumulus cell
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/PBB_GE_ARNT_218222_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARNT_218222_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e4/PBB_GE_ARNT_218221_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARNT_218221_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/95/PBB_GE_ARNT_210828_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARNT_210828_s_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - sequence-specific DNA binding
- ДНК-связывающий
- protein dimerization activity
- DNA-binding transcription factor activity
- transcription coactivator activity
- aryl hydrocarbon receptor binding
- transcription factor binding
- связывание с белками плазмы
- protein heterodimerization activity
- transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
- DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
- гомодимеризация белка
- sequence-specific double-stranded DNA binding
- nuclear receptor activity
| Компонент клетки | - цитоплазма
- transcription regulator complex
- нуклеоплазма
- RNA polymerase II transcription regulator complex
- клеточное ядро
- ядерные тельца
| Биологический процесс | - positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
- дифференцировка клеток
- response to hypoxia
- ДНК-зависимая регуляция транскрипции
- positive regulation of endothelial cell proliferation
- regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress
- positive regulation of erythrocyte differentiation
- embryonic placenta development
- mRNA transcription by RNA polymerase II
- positive regulation of protein sumoylation
- транскрипция, ДНК-зависимая
- ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции
- intracellular receptor signaling pathway
- regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
- positive regulation of vascular endothelial growth factor production
- positive regulation of glycolytic process
- положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
- positive regulation of hormone biosynthetic process
- xenobiotic metabolic process
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426
|
---|
NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226 |
| |
---|
RefSeq (белок) | NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514
|
---|
NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 1: 150.81 – 150.88 Mb | Chr 3: 95.34 – 95.4 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы[5].
Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.
Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.
Взаимодействия с другими белками
ARNT взаимодействует со следующими белками:
- AIP,[7][8]
- AHR,[9][10][11][12]
- EPAS1,[13]
- HIF1A,[13][14]
- NCOA2,[15][15]
- SIM1,[14][16] и
- SIM2.[14][16][17][18]
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
- ↑ Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]
- ↑ Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.
- ↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.
- ↑ Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.
- ↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.
- ↑ Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology[англ.] : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.
- ↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.
- ↑ 1 2 Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.
- ↑ 1 2 3 Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.
- ↑ 1 2 Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.
- ↑ 1 2 Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.
- ↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.
- ↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.