CLDN1

CLDN1
식별자
다른 이름CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1
외부 IDOMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1
유전자 위치 (인간)
3번 염색체
염색체3번 염색체[1]
3번 염색체
CLDN1의 유전자 위치
CLDN1의 유전자 위치
자리3q28시작190,305,707 bp[1]
190,322,446 bp[1]
유전자 위치 ()
16번 염색체 (쥐)
염색체16번 염색체 (쥐)[2]
16번 염색체 (쥐)
CLDN1의 유전자 위치
CLDN1의 유전자 위치
자리16|16 B2시작26,175,392 bp[2]
26,190,591 bp[2]
RNA 발현 패턴
Bgee
인간(동원체)
최상위 발현
  • skin of thigh

  • germinal epithelium

  • skin of hip

  • 배의 피부

  • olfactory zone of nasal mucosa

  • epithelium of nasopharynx

  • 왼자궁관

  • 간오른엽

  • 유두

  • gingival epithelium
최상위 발현
  • 망막색소상피세포

  • decidua

  • 대구치

  • skin of external ear

  • 입술

  • Epithelium of choroid plexus

  • epidermis

  • 모낭

  • 배의 피부

  • lumbar spinal ganglion
추가 참조 발현 데이터
BioGPS
추가 참조 발현 데이터
유전자 온톨로지
분자 함수
  • 단백질 결합
  • 구조 분자 활성
  • identical protein binding
  • virus receptor activity
세포 성분
  • 세포막
  • integral component of membrane
  • 세포연접
  • 세포막
  • integral component of plasma membrane
  • apical plasma membrane
  • lateral plasma membrane
  • bicellular tight junction
  • 세포질
  • basolateral plasma membrane
생물학적 과정
  • 바이러스 침입
  • cell-cell junction organization
  • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules
  • viral process
  • protein homooligomerization
  • protein heterooligomerization
  • establishment of skin barrier
  • bicellular tight junction assembly
  • 노화
  • establishment of blood-nerve barrier
  • response to toxic substance
  • response to lipopolysaccharide
  • hyperosmotic salinity response
  • response to ethanol
  • xenobiotic transport across blood-nerve barrier
  • response to interleukin-18
  • cellular response to lead ion
  • cellular response to interferon-gamma
  • cellular response to tumor necrosis factor
  • response to dexamethasone
  • cellular response to transforming growth factor beta stimulus
  • establishment of endothelial intestinal barrier
  • liver regeneration
  • positive regulation of bicellular tight junction assembly
  • cellular response to butyrate
출처: Amigo / QuickGO
동원체
인간
앙트레

9076

12737

앙상블

ENSG00000163347

ENSMUSG00000022512

유니프롯

O95832

O88551

RefSeq (mRNA)

NM_021101

NM_016674

RefSeq(단백질)

NP_066924

NP_057883

위치(UCSC)Chr 3: 190.31 – 190.32 MbChr 16: 26.18 – 26.19 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집쥐 보기/편집

클라우딘 1(claudin-1)은 인간에서 CLDN1 유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.[5][6] 클라우딘 그룹에 속한다.

기능

견고 접합은 상피 또는 내피 세포에서 하나의 세포 대 세포 접착 모드를 나타내며, 세포 주위에 연속적인 패킹을 형성하고 용질 및 물이 파라셀(paracell) 공간을 자유롭게 통과하는 것을 방지하기위한 물리적 장벽으로서 작용한다. 이 접합부는 바깥 쪽을 향한 세포질 소엽에 연속 네트워킹 가닥 세트로 구성되어 있으며, 안쪽을 향한 세포 외 기질에 상보적인 홈이 있다. 클라우딘 그룹의 구성원이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 일체형 막 단백질 및 견고 접합 가닥의 성분이다. 이 단백질의 돌연변이는 신생아 홍반증 경화성 담관염 증후군을 초래한다.[7]

상호 작용

CLDN1은 CLDN5[8] 및 CLDN3과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

각주

  1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163347 - 앙상블, May 2017
  2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022512 - 앙상블, May 2017
  3. “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  4. “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》. 
  5. “Assignment of claudin-1 (CLDN1) to human chromosome 3q28-->q29 with somatic cell hybrids”. 《Cytogenet. Cell Genet.》 88 (3–4): 217. Jun 2000. doi:10.1159/000015553. PMID 10828592. 
  6. “Claudin multigene family encoding four-transmembrane domain protein components of tight junction strands”. 《Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.》 96 (2): 511–6. Mar 1999. Bibcode:1999PNAS...96..511M. doi:10.1073/pnas.96.2.511. PMC 15167. PMID 9892664. 
  7. “Entrez Gene: CLDN1 claudin 1”. 
  8. “Role of claudin interactions in airway tight junctional permeability”. 《Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol.》 285 (5): L1166-78. Nov 2003. doi:10.1152/ajplung.00182.2003. PMID 12909588.