ETS1 |
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PDBに登録されている構造 |
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PDB | オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj |
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PDBのIDコード一覧 |
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1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0 |
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識別子 |
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記号 | ETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor |
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外部ID | OMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1 |
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遺伝子の位置 (ヒト) |
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| 染色体 | 11番染色体 (ヒト)[1] |
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| バンド | データ無し | 開始点 | 128,458,761 bp[1] |
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終点 | 128,587,558 bp[1] |
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遺伝子の位置 (マウス) |
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| 染色体 | 9番染色体 (マウス)[2] |
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| バンド | データ無し | 開始点 | 32,636,221 bp[2] |
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終点 | 32,757,820 bp[2] |
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遺伝子オントロジー |
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分子機能 | • DNA結合 • sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription factor activity • 転写因子結合 • 血漿タンパク結合 • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific double-stranded DNA binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone acetyltransferase binding
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細胞の構成要素 | • 細胞質 • transcription regulator complex • 核質 • 細胞核
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生物学的プロセス | • regulation of apoptotic process • 下垂体発生 • エストラジオールへの反応 • response to interleukin-1 • 低酸素症への反応 • regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of erythrocyte differentiation • cell motility • 発情周期 • 免疫系プロセス • regulation of transcription by RNA polymerase II • response to antibiotic • female pregnancy • angiogenesis involved in wound healing • positive regulation of cell migration • response to mechanical stimulus • response to laminar fluid shear stress • negative regulation of cell cycle • regulation of angiogenesis • transcription by RNA polymerase II • regulation of extracellular matrix disassembly • transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell migration • positive regulation of transcription, DNA-templated • PML body organization • response to wounding • 免疫応答 • positive regulation of cell population proliferation • 視床下部発生 • negative regulation of inflammatory response • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of inflammatory response • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell • positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • 細胞分化
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出典:Amigo / QuickGO |
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オルソログ |
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種 | ヒト | マウス |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (mRNA) | |
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NM_001143820 NM_001162422 NM_005238 NM_001330451 |
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RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001137292 NP_001155894 NP_001317380 NP_005229 |
| NP_001033731 NP_035938 NP_001359463 NP_001359464 NP_001359465
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NP_001359466 |
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場所 (UCSC) | Chr 11: 128.46 – 128.59 Mb | Chr 11: 32.64 – 32.76 Mb |
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PubMed検索 | [3] | [4] |
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ウィキデータ |
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ETS1(C-ets-1)は、ヒトではETS1遺伝子にコードされるタンパク質である[5]。このタンパク質は転写因子のETSファミリー(英語版)に属する[6]。
機能
ETS遺伝子はヒトには28種類、マウスには27種類存在する。これらはETSドメインと呼ばれるウィングドヘリックスターンヘリックス(winged-helix-turn-helix)モチーフを介してDNAに結合し、GGAA/Tコアエレメントを含むDNA配列を特異的に認識する。一方で、これらのETSタンパク質はGGAA/Tコアエレメントに近接する配列に対する選択性は大きく異なる。また、ETS1の結合のコンセンサス配列はPuCC/a-GGAA/T-GCPyであるが、実際に存在するETS1応答性GGAA/Tエレメントの多くはこのコンセンサス配列とは異なっている。このことは、いくつかの他の転写因子がETS1の好ましくないDNA配列に対する結合を促進している可能性を示唆している。ChIP-Seq(英語版)による研究では、ETS1はAGGAAGとCGGAAGモチーフの双方に結合できることが示されている[7]。
ETS1は単量体としてDNAに結合する。C末端ドメインのセリン残基(ヌクレオチド配列ではエクソン7に位置する)のリン酸化は、自己阻害によってETS1を不活性状態にすることが知られている。ETS1の活性化にはいくつかの方法が存在する。1つ目はETS1の脱リン酸化、2つ目はホモ二量体化である。ETS1のホモ二量体化は、DNAに結合部位が適切な向きと間隔で存在する場合に生じる。このように、エンハンサーやプロモーター内の結合部位の配置によるETS1の自己阻害の緩和または許容は、ETS1が実際に特定の部位に結合するかどうかに強く影響する可能性がある。3つ目は、ERK2とRasによるThr38のリン酸化による活性化である。末端が切り詰められたアイソフォームは、このERK2によるリン酸化を受けない。このアイソフォームは細胞質に局在し、ドミナントネガティブなアイソフォームとして機能する。反対に、エクソン7を欠くもう1つのアイソフォームは恒常的に活性化状態である。Ras応答性遺伝子の多くにはETS/AP1認識モチーフが組み合わされて存在しており、Rasによって刺激されるとETSとAP1が相乗的に転写を活性化する[8]。
ノックアウトマウス
Ets1のノックアウトマウスでは、胸腺の分化の異常、末梢のT細胞数の減少、IL-2産生の低下、T細胞のメモリー/エフェクター表現型への偏り、Th1、Th2サイトカイン産生の障害がみられる。Ets1ノックアウトマウスは、Th1、Th2、Treg細胞の発生の異常を示すが、Th17細胞の数は増加する。Ets1ノックアウトマウスのCD4+/CD8+胸腺細胞(英語版)では、代替系統に対応する遺伝子発現プログラムの抑制とT細胞特異的遺伝子のアップレギュレーションの双方の障害がみられる[7]。
相互作用
ETS1はTTRAP(英語版)[9]、UBE2I(英語版)[10]、DAXX(英語版)[11]と相互作用することが示されている。
ETS1は、ヌクレオソームに結合したDNAと、ヌクレオソームから除去されたDNAの双方に結合することができ、ETS1の抑制によってETS1が通常結合する部位のヌクレオソーム占有率が上昇することが示されている[7]。
DNA修復因子との相互作用
DNA修復遺伝子プロモーター
DNA修復タンパク質PARP1のmRNAとタンパク質のレベルはETS1の発現レベルによって部分的に制御されており、ETS1はPARP1のプロモーター領域の複数の結合部位と相互作用する[12]。ETS1がPARP1プロモーター上の結合部位にどの程度できるかは、結合部位のCpGアイランドのメチル化状態に依存している[13]。結合部位のCpGアイランドが低メチル化状態である場合、PARP1の発現レベルは上昇する[13]。100歳以上の高齢者ではPARP1の恒常的な発現レベルは高く、より効率的にDNA修復が行われることがその長寿に寄与していると考えられている。こうしたPARP1の発現レベルの上昇は、PARP1の発現のエピジェネティックな制御の変化によるものであると考えられている[14]。
ETS1の発現の増加は、DNA修復遺伝子MUTYH(英語版)、BARD1(英語版)、ERCC1、XPA(英語版)など約50の標的遺伝子の発現を上昇させる。ETS1の発現の増加はシスプラチンによる細胞死に対する抵抗性を引き起こすが、その抵抗性の一部はDNA修復遺伝子の発現の上昇によるものであると考えられている[15]。
DNA修復タンパク質との相互作用
ETS1の機能はタンパク質間相互作用によって調節される[16][17]。特に、ETS1はDNA依存性プロテインキナーゼ(DNA-PK)と相互作用する。DNA-PKはDNA-PKcsとDNA修復タンパク質Kuから構成され、Ku自身もKu70(XRCC6)とKu80(XRCC5)の2つのポリペプチドからなるヘテロ二量体である[17]。ETS1とDNA-PKの相互作用はETS1をリン酸化する[17]。こうしたリン酸化は、ETS1の標的遺伝子のレパートリーを変化させる[18]。DNA-PKを構成するKu80は単独でもETS1と相互作用し、少なくとも1つの転写活性をダウンレギュレーションすることが示されている[17]。
ETS1はPARP1タンパク質とも相互作用する。ETS1はPARP1を活性化し、ニックDNAが存在しない場合でもPARP1自身や他のタンパク質に対するポリADPリボシル化を引き起こす。PARP1はプロモーター上でのETS1のトランス活性化能を活性化する。その後、活性化されたPARP1はETS1をポリADPリボシル化し、ETS1のユビキチン化とプロテアソームによる分解を促進することで、ETS1の過剰な活性を防いでいるようである[19]。
出典
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017
- ^ Human PubMed Reference:
- ^ Mouse PubMed Reference:
- ^ “Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours”. Nature 359 (6391): 162–5. (Sep 1992). Bibcode: 1992Natur.359..162D. doi:10.1038/359162a0. PMID 1522903.
- ^ “Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family”. Annals of the New York Academy of Sciences 1114 (1): 36–47. (Oct 2007). Bibcode: 2007NYASA1114...36D. doi:10.1196/annals.1396.022. PMID 17986575.
- ^ a b c “Dynamic recruitment of Ets1 to both nucleosome-occupied and -depleted enhancer regions mediates a transcriptional program switch during early T-cell differentiation”. Nucleic Acids Research 44 (8): 3567–85. (2016-05-05). doi:10.1093/nar/gkv1475. ISSN 0305-1048. PMC 4856961. PMID 26673693. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4856961/.
- ^ “Ets transcription factors: nuclear effectors of the Ras-MAP-kinase signaling pathway”. Trends Biochem. Sci. 23 (6): 213–6. (1998). doi:10.1016/S0968-0004(98)01211-0. PMID 9644975.
- ^ “EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function”. Oncogene 22 (18): 2699–709. (May 2003). doi:10.1038/sj.onc.1206374. PMID 12743594.
- ^ “Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme”. Oncogene 15 (12): 1489–95. (Sep 1997). doi:10.1038/sj.onc.1201301. PMID 9333025.
- ^ “EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes”. Oncogene 19 (6): 745–53. (Feb 2000). doi:10.1038/sj.onc.1203385. PMID 10698492.
- ^ “Regulation of the human poly(ADP-ribose) polymerase promoter by the ETS transcription factor”. Oncogene 18 (27): 3954–62. (1999). doi:10.1038/sj.onc.1202778. PMID 10435618.
- ^ a b “Hypomethylation of ETS transcription factor binding sites and upregulation of PARP1 expression in endometrial cancer”. Biomed Res Int 2013: 946268. (2013). doi:10.1155/2013/946268. PMC 3666359. PMID 23762867. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3666359/.
- ^ “Oxidative DNA damage repair and parp 1 and parp 2 expression in Epstein-Barr virus-immortalized B lymphocyte cells from young subjects, old subjects, and centenarians”. Rejuvenation Res 10 (2): 191–204. (2007). doi:10.1089/rej.2006.0514. PMID 17518695. https://www.researchgate.net/publication/6313423.
- ^ “Role of the transcription factor Ets-1 in cisplatin resistance”. Mol. Cancer Ther. 3 (7): 823–32. (2004). PMID 15252143.
- ^ “Regulation of Ets function by protein - protein interactions”. Oncogene 19 (55): 6514–23. (2000). doi:10.1038/sj.onc.1204035. PMID 11175367.
- ^ a b c d “DNA-dependent protein kinase is a novel interaction partner for Ets-1 isoforms”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 390 (3): 839–44. (2009). doi:10.1016/j.bbrc.2009.10.059. PMID 19836356.
- ^ “A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions”. J. Mol. Biol. 427 (8): 1655–69. (2015). doi:10.1016/j.jmb.2014.07.020. PMID 25083921.
- ^ “The level of Ets-1 protein is regulated by poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) in cancer cells to prevent DNA damage”. PLOS ONE 8 (2): e55883. (2013). Bibcode: 2013PLoSO...855883L. doi:10.1371/journal.pone.0055883. PMC 3566071. PMID 23405229. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3566071/.
関連文献
- “Structure, expression and alternative splicing of the human c-ets-1 proto-oncogene”. Oncogene Research 3 (3): 239–46. (1988). PMID 3060801.
- “The transcription factor Ets-1 in breast cancer”. Frontiers in Bioscience 10 (1–3): 506–11. (Jan 2005). doi:10.2741/1546. PMID 15574387.
外部リンク
- ETS1 protein, human - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス(英語)
- Drosophila pointed - The Interactive Fly
- FactorBook ETS1