Tissue Microarray
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I Tissue microarrays (in sigla TMAs) sono blocchi in paraffina nei quali sono collezionati prelievi di tessuto (tissue "cores") sotto forma di cilindretti provenienti da molteplici pazienti. I tissue "cores" sono assemblati in stile-array per consentire un'analisi istologica sotto vari aspetti.
Storia
Uno dei vincoli principali nell'analisi clinica e molecolare dei tessuti è dato da:
- la molteplicità della natura delle procedure di preparazione dei tessuti;
- una disponibilità limitata di reagenti diagnostici;
- la grandezza limitata del tessuto prelevato dal paziente.
La tecnica dei tissue microarray venne sviluppata per far fronte a molti di questi problemi.
Dei blocchi multi-tessuto vennero introdotti per la prima volta nel 1986 da H.Battifora con il cosiddetto "tissue block multitumorale (cosiddetto "sausage")". Venne migliorato nel 1990 e trasformato nel "checkerboard tissue block". Solo nel 1998, J. Kononen e collaboratori svilupparono la tecnica attuale, che utilizza un approccio molto semplice al fine di produrre blocchi di tessuto della stessa forma e grandezza in maniera tale che possano essere arrangiati (o utilizzando il termine tecnico "arrayed") in maniera precisa e densamente concentrata.
Procedura
Durante la tecnica dei TMAs, si utilizza un ago cavo per rimuovere dei piccoli "core" di tessuto dalla regione di interesse dal diametro di circa 0,6 mm. Il tessuto dal quale si preleva il blocchetto è incluso in paraffina (es. tessuti tipicamente prelevati da biopsie cliniche o da samples di tumori). Questi tissue core sono dunque inseriti in un recipiente di paraffina in maniera estremamente ordinata, per formare un pattern di array.
Le sezioni provenienti da questo blocco in paraffina sono successivamente sezionate mediante un microtomo, montate su un vetrino da microscopio e successivamente analizzati mediante qualsiasi metodo di analisi istologica standard. Ogni blocco di microarray può essere sezionato in 100-500 unità, che possono essere singolarmente utilizzate per altri test. I test comunemente utilizzati nei TMAs includono:
- immunoistochimica;
- ibridizzazione in situ con fluorescenza.
I TMAs sono particolarmente utili nell'analisi di prelievi di masse tumorali.
Una variazione dei TMAs è data dai Frozen tissue array.
Utilizzo in Anatomia Patologica e nella ricerca di base
L'utilizzo dei tissue microarrays in combinazione con l'immunoistochimica costituisce uno dei metodi principali per lo studio e l'efficienza dei biomarkers del cancro, soprattutto in diversi studi di coorte dove la popolazione è costituita da pazienti malati di cancro.
La possibilità di assemblare un enorme numero di prelievi rappresentativi di masse tumorali (a partire da una ben definita coorte di pazienti) che sia associata ad un enorme database clinico dona all'anatomopatologo o al ricercatore una potente risorsa per lo studio della correlazione tra patterns di espressione proteica e parametri clinici.
Dal momento che i prelievi di pazienti diversi sono assemblati nello stesso blocco ricevente, le sezioni possono essere preparate con lo stesso protocollo in maniera tale da evitare la variabilità sperimentale ed artefatti di natura tecnica. Le coorti cliniche di pazienti malati di cancro sono state utilizzate per lo studio e la scoperta di molteplici biomarkers di cancro predittivi, diagnostici e prognostici. Un esempio è dato dallo studio di biomarker per il cancro del polmone, mammella, colon-rettale e a cellule renali.[1][2][3][4]
L'immunoistochimica in combinazione con i TMAs è stata utilizzata con enorme successo in esperimenti a larga-scala per creare una mappa di espressione proteica su scala globale.[5] Il Human Protein Atlas si è basato soprattutto su queste tecniche per analizzare l'espressione di tutte le proteine umane nella maggior parte dei tessuti e organi umani normali, oltre che in tutte le forme principali di cancro umano.[6][7][8][9]
Collegamenti
- Citomica
- MicroArray ed Espressione Genica (MAGE)
Note
- ^ (EN) Gabriela Gremel, Julia Bergman, Dijana Djureinovic, Per-Henrik Edqvist, Vikas Maindad, Bhavana M Bharambe, Wasif Ali Z A Khan, Sanjay Navani e Jacob Elebro, A systematic analysis of commonly used antibodies in cancer diagnostics, in Histopathology, vol. 64, n. 2, 1º gennaio 2014, pp. 293-305, DOI:10.1111/his.12255, ISSN 1365-2559 (WC · ACNP).
- ^ Robert L. Camp, Veronique Neumeister e David L. Rimm, A Decade of Tissue Microarrays: Progress in the Discovery and Validation of Cancer Biomarkers, in Journal of Clinical Oncology, vol. 26, n. 34, 1º dicembre 2008, pp. 5630-5637, DOI:10.1200/jco.2008.17.3567, ISSN 0732-183X (WC · ACNP).
- ^ (EN) Hanna Fredholm, Kristina Magnusson, Linda S. Lindström, Hans Garmo, Sonja Eaker Fält, Henrik Lindman, Jonas Bergh, Lars Holmberg e Fredrik Pontén, Long-term outcome in young women with breast cancer: a population-based study, in Breast Cancer Research and Treatment, vol. 160, n. 1, 1º novembre 2016, pp. 131-143, DOI:10.1007/s10549-016-3983-9, ISSN 0167-6806 (WC · ACNP).
- ^ Gabriela Gremel, Dijana Djureinovic, Marjut Niinivirta, Alexander Laird, Oscar Ljungqvist, Henrik Johannesson, Julia Bergman, Per-Henrik Edqvist e Sanjay Navani, A systematic search strategy identifies cubilin as independent prognostic marker for renal cell carcinoma, in BMC Cancer, vol. 17, 4 gennaio 2017, p. 9, DOI:10.1186/s12885-016-3030-6, ISSN 1471-2407 (WC · ACNP).
- ^ Caroline Kampf, IngMarie Olsson, Urban Ryberg, Evelina Sjöstedt e Fredrik Pontén, Production of Tissue Microarrays, Immunohistochemistry Staining and Digitalization Within the Human Protein Atlas, in Journal of Visualized Experiments, n. 63, 31 maggio 2012, DOI:10.3791/3620, ISSN 1940-087X (WC · ACNP).
- ^ (EN) F. Pontén, J. M. Schwenk, A. Asplund e P.-H. D. Edqvist, The Human Protein Atlas as a proteomic resource for biomarker discovery, in Journal of Internal Medicine, vol. 270, n. 5, 1º novembre 2011, pp. 428-446, DOI:10.1111/j.1365-2796.2011.02427.x, ISSN 1365-2796 (WC · ACNP).
- ^ The Human Protein Atlas, su proteinatlas.org. URL consultato il 3 ottobre 2017.
- ^ (EN) Mathias Uhlén, Linn Fagerberg, Björn M. Hallström, Cecilia Lindskog, Per Oksvold, Adil Mardinoglu, Åsa Sivertsson, Caroline Kampf e Evelina Sjöstedt, Tissue-based map of the human proteome, in Science, vol. 347, n. 6220, 23 gennaio 2015, p. 1260419, DOI:10.1126/science.1260419, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 25613900.
- ^ (EN) Mathias Uhlen, Cheng Zhang, Sunjae Lee, Evelina Sjöstedt, Linn Fagerberg, Gholamreza Bidkhori, Rui Benfeitas, Muhammad Arif e Zhengtao Liu, A pathology atlas of the human cancer transcriptome, in Science, vol. 357, n. 6352, 18 agosto 2017, pp. eaan2507, DOI:10.1126/science.aan2507, ISSN 0036-8075 (WC · ACNP), PMID 28818916.
Bibliografia
- Battifora H: The multitumor (sausage) tissue block: novel method for immunohistochemical antibody testing. Lab Invest 1986, 55:244-248.
- Battifora H, Mehta P: The checkerboard tissue block. An improved multitissue control block. Lab Invest 1990, 63:722-724.
- Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Nat Med 1998, 4:844-847.
Altri progetti
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Collegamenti esterni
- Human Protein Atlas
- National Cancer Institute Tissue Array Research Program
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