USP18

USP18
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

5CHT, 5CHV

Identifiants
AliasesUSP18, UBP43
IDs externesOMIM: 607057 MGI: 1344364 HomoloGene: 8047 GeneCards: USP18
Position du gène (Homme)
Chromosome 22 humain
Chr.Chromosome 22 humain[1]
Chromosome 22 humain
Localisation génomique pour USP18
Localisation génomique pour USP18
Locus22q11.21Début18,150,170 bp[1]
Fin18,177,397 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour USP18
Localisation génomique pour USP18
Locus6 F1|6 57.17 cMDébut121,222,865 bp[2]
Fin121,247,876 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • gonade

  • left testis

  • right testis

  • testicule

  • subcutaneous adipose tissue

  • foie

  • ganglion lymphatique

  • right lobe of liver

  • îlot de Langerhans

  • placenta
Fortement exprimé dans
  • mucous cell of stomach

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • Caduque basale

  • thymus

  • vésicule séminale

  • granulocyte

  • glande submandibulaire

  • ganglion mésentérique

  • lumbar spinal ganglion

  • îlot de Langerhans
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • activité peptidasique
  • cysteine-type peptidase activity
  • liaison protéique
  • activité hydrolase
  • thiol-dependent deubiquitinase
  • ISG15-specific protease activity
  • cysteine-type endopeptidase activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • noyau
  • cytosol
Processus biologique
  • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
  • ubiquitin-dependent protein catabolic process
  • protéolyse
  • protein deubiquitination
  • regulation of inflammatory response
  • regulation of protein stability
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

11274

24110

Ensembl

ENSG00000184979

ENSMUSG00000030107

UniProt

Q9UMW8

Q9WTV6

RefSeq (mRNA)

NM_017414

NM_011909

RefSeq (protéine)

NP_059110

NP_036039

Localisation (UCSC)Chr 22: 18.15 – 18.18 MbChr 6: 121.22 – 121.25 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'USP18 (pour « Ubiquitin specific peptidase 18 »), appelé aussi UBP43, est une peptidase. Son gène, USP18 est situé sur le chromosome 6 humain.

Rôle

Il se fixe à une sous-unité du récepteur aux interférons de type I (IFNAR2), bloquant la fixation du JAK à ce dernier[5] et empêchant l'action de l'interféron de type I.

Il a un rôle dans la dégradation de l'ISG15[6].

En médecine

Une mutation du gène donne un syndrome comprenant une microcéphalie, une dilatation des ventricules cérébraux et des calcifications cérébrales [7]. Le ruxolitinib, un inhibiteur du JAK, donné précocement, peut en améliorer le pronostic[8].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000184979 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030107 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Malakhova OA, Kim KI, Luo JK et al. UBP43 is a novel regulator of interferon signaling independent of its ISG15 isopeptidase activity, EMBO J, 2006;25:2358-2367
  6. Malakhov MP, Malakhova OA, Kim KI, Ritchie KJ, Zhang DE, UBP43 (USP18) specifically removes ISG15 from conjugated proteins, J Biol Chem, 2002;277:9976-9981
  7. Meuwissen ME, Schot R, Buta S et al. Human USP18 deficiency underlies type 1 interferonopathy leading to severe pseudo-TORCH syndrome, J Exp Med, 2016;213:1163-1174.
  8. Alsohime F, Martin-Fernandez M, Temsah MH et al. JAK inhibitor therapy in a child with inherited USP18 deficiency, N Engl J Med, 2020;382:256-265
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