EBF1

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EBF1
Structure de la protéine EBF1. Basée sur l'identifiant PDB 3LYR.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

3LYR, 3MQI

Identifiants
AliasesEBF1, Facteur de transcription COE1
IDs externesOMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1
Position du gène (Homme)
Chromosome 5 humain
Chr.Chromosome 5 humain[1]
Chromosome 5 humain
Localisation génomique pour EBF1
Localisation génomique pour EBF1
Locus5q33.3Début158,695,916 bp[1]
Fin159,099,916 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 11 (souris)
Chr.Chromosome 11 (souris)[2]
Chromosome 11 (souris)
Localisation génomique pour EBF1
Localisation génomique pour EBF1
Locus11 B1.1|11 26.45 cMDébut44,617,317 bp[2]
Fin45,008,091 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • jointure synoviale

  • membrane synoviale

  • tendon calcanéen

  • ovocyte

  • buccal mucosa cell

  • skin of hip

  • cardiac muscle tissue of right atrium

  • parietal pleura

  • veine cave

  • ganglion sensitif d’un nerf spinal
Fortement exprimé dans
  • artère carotide externe

  • artère carotide interne

  • Ganglion de Gasser

  • ganglion cervical supérieur

  • ganglion sensitif d’un nerf spinal

  • tube neural

  • cheville

  • lumbar spinal ganglion

  • subcutaneous adipose tissue

  • tissu adipeux brun
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • liaison protéique
  • liaison ion métal
  • DNA-binding transcription factor activity
  • protein dimerization activity
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • C2H2 zinc finger domain binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • noyau
Processus biologique
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • transcription, DNA-templated
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

1879

13591

Ensembl

ENSG00000164330

ENSMUSG00000057098

UniProt

Q9UH73

Q07802

RefSeq (mRNA)
NM_001290360
NM_024007
NM_182708
NM_001324101
NM_001324103

NM_001324106
NM_001324107
NM_001324108
NM_001324109
NM_001324111
NM_001364155
NM_001364156
NM_001364157
NM_001364158
NM_001364159

NM_001290709
NM_001290710
NM_001290711
NM_007897

RefSeq (protéine)
NP_001277289
NP_001311030
NP_001311032
NP_001311035
NP_001311036

NP_001311037
NP_001311038
NP_001311040
NP_076870
NP_874367
NP_001351084
NP_001351085
NP_001351086
NP_001351087
NP_001351088

NP_001277638
NP_001277639
NP_001277640
NP_031923
NP_001349498

NP_001349500
NP_001349503
NP_001349504
NP_001349505
NP_001349506
NP_001349507
NP_001349508

Localisation (UCSC)Chr 5: 158.7 – 159.1 MbChr 11: 44.62 – 45.01 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le facteur de transcription COE1 est une protéine codée par le gène EBF1 chez l'homme. EBF1 est le sigle anglais de Early B-Cell Factor 1[5],[6],[7].

Interactions

Il fut montré qu'EBF1 interagit avec ZNF423[8] et CREB[9].

Notes et références

  1. ↑ a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164330 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057098 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ « Symbol Report: EBF1 »
  6. ↑ « Gene for a tissue-specific transcriptional activator (EBF or Olf-1), expressed in early B lymphocytes, adipocytes, and olfactory neurons, is located on human chromosome 5, band q34, and proximal mouse chromosome 11 », Mamm. Genome, vol. 5, no 4,‎ , p. 211–5 (PMID 8012110, DOI 10.1007/BF00360547)
  7. ↑ « Entrez Gene: EBF1 early B-cell factor 1 »
  8. ↑ « Cloning and functional characterization of Roaz, a zinc finger protein that interacts with O/E-1 to regulate gene expression: implications for olfactory neuronal development », J. Neurosci., vol. 17, no 11,‎ , p. 4159–69 (PMID 9151733)
  9. ↑ « Inhibition of p300/CBP by early B-cell factor », Mol. Cell. Biol., vol. 23, no 11,‎ , p. 3837–46 (PMID 12748286, PMCID 155219, DOI 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003)

Bibliographie

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Liens externes

  • FactorBook EBF1
v · m
Introduction à la génétique
Transcription
Régulation de la transcription
Régulation post-transcriptionnelle
Traduction
Régulation de la traduction
Régulation post-traductionnelle
Contrôle épigénétique
  • icône décorative Portail de la biologie cellulaire et moléculaire