Die Einteilung der Viren in Systematiken ist kontinuierlicher Gegenstand der Forschung. So existieren neben- und nacheinander verschiedene Virusklassifikationen sowie die offizielle Virus-Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Die hier behandelte Gruppe ist als Taxon durch neue Forschungen obsolet geworden oder aus anderen Gründen nicht Teil der offiziellen Virus-Taxonomie.
Typisches Aussehen eines Virusteilchens mit Myoviren-Morphologie, sheath: Schwanzscheide, baseplate: BasisplatteDetailzeichnung im Fall eines Bakteriophage vom Morphotyp der Myoviren mit kontraktilem Schwanzeil
Die morphologisch begründete (nicht-taxonomische) Gruppe der Myoviren (englischmyoviruses, früher auch Morphotyp A genannt) umfasst eine Reihe von Familien, Unterfamilien und Gattungen von Viren mit einem linearen Molekül doppelsträngiger DNA (dsDNA) als Genom.
Die Myoviren werden unterteilt in Subtypen: 1: Kopf ohne „Fühler“, aber kurze Anhängsel am Schwanz; 2: kragenartige Struktur zwischen Kopf und Schwanz und kurze Anhängsel am Schwanz.[2]
Alle Mitglieder gehören zur Klasse der Caudoviricetes („Schwanzviren“ – Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur): Ihre Mitglieder besitzen ein ikosaedrischesKapsid und ein Schwanzteil; wegen dessen kontraktiler Eigenschaft leitet sich der Gruppenname von griechischμυόςmyos, deutsch ‚Muskel‘ ab. Als Wirte dienen Prokaryoten, meist Bakterien (Bakteriophagen), aber teilweise auch Archaeen. Innerhalb der Klasse Caudoviricetes zeichnen sich die Myoviren außerdem durch besonders große, teilweise langgestreckte Kapside (z. B. T4-Phage: 111 × 78 nm) und ein sehr großes Genom (34–169 kBp) aus (siehe Riesenphagen). Der wichtigste Vertreter ist der schon früh entdeckte T4-Phage (Spezies Enterobacteria-Virus T4, Gattung Tequatrovirus), dessen besondere Morphologie und genetische Eigenschaften in der molekularbiologischen Forschung eine herausragende Rolle spielte. Die von diesem Phagen abgeleitete T4-DNA-Ligase findet heute noch Verwendung in der Molekularbiologie. Weitere Mitglieder von Bedeutung sind der Vibrio-Phage KVP40 (Spezies Vibrio-Virus KVP40, Gattung Schizotequatrovirus), der Pseudomonas-Phage phiKZ (Spezies Pseudomonas-Virus phiKZ, Gattung Phikzvirus), der Bakteriophage P1 (Spezies Escherichia-Virus P1, Gattung Punavirus, siehe P1 Artificial Chromosome) u. a.
Die Gruppe galt lange Zeit als ein Virustaxon im Rang einer Virusfamilie mit der Bezeichnung Myoviridae. Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Familie mitsamt der Ordnung Caudovirales wegen fehlender Monophylie aufzulösen und (wie damals bereits z. T. geschehen) durch neu zu schaffende Familien zu ersetzen, damit neue Ergebnisse aus der Metagenomik in die Taxonomie aufgenommen werden können.[3] Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat dem im März 2022 entsprochen.[1] Gemäß Vorschlag bleibt die Bezeichnung „Myoviren“ (englischmyoviruses) aber als informeller Sammelbegriff morphologisch ähnlicher Prokaryotenviren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom erhalten.[3]
Listeria-Phage A511 (Herelleviridae): Aufbau der Basisplatte und Veränderung während der Absorption an der Zellwand des Wirtsbalterium.
Inhaltsverzeichnis
1Systematik
2Anmerkungen
3Literatur
4Weblinks
5Einzelnachweise
Systematik
Die folgende Systematik nach ICTV (Stand 13. Juni 2022)[4] umfasst nur einen Teil der zugehörigen Spezies:
Nicht-taxonomische Gruppe Myoviren (en. myoviruses, auch Caudoviricetes „Morphotyp A“)
Ordnung Thumleimavirales (Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur mit Myo- und Siphoviren-Morphologie, hier nur die Myoviren-Familie(n))[5]
Familie Hafunaviridae (früher zu Myoviridae, Myoviren)
Spezies „Mycobacterium-Phage Nidhogg“ (en. „Mycobacterium phage Nidhogg“) (Vorschlag, wohl zu unterscheiden von Asgardviren mit vorgeschlagener Bezeichnung Nidhogg-Viren, en. Nidhogg viruses)[12]
Spezies Clostridioides-Virus phiCD27 (wiss. Colneyvirus CD27, früher Clostridioides virus phiCD27; als Clostridium virus phiCD27 offenbar in der NCBI-Taxonomie fehlerhaft der Gattung Lubbockvirus zugeordnet; mit Clostridium phage phiCD27, ΦCD27)[27]
Spezies Colneyvirus CD505
Spezies Colneyvirus CDKM9
Spezies Colneyvirus CDKM15
Spezies Colneyvirus MMP02
Gattung Derbicusvirus
Gattung Dibbivirus
Gattung Donellivirus
Spezies Bacillus virus G
Gattung Elmenteitavirus
Gattung Elvirus (früher Ellikevirus)
Spezies Pseudomonas-Virus EL (wiss. Elvirus EL) mit Pseudomonas-Phage EL (phiEL)[28][29] und Pseudomonas-Phage ELvir (phiELvir), einer virulenten Mutante[28] – früher zu Phikzvirus
Spezies Escherichia-Virus Mu (wiss. Muvirus mu, mit Enterobacteria-Phage Mu, alias Bacteriophage Mu oder Myovirus Mu)[37] (siehe Barbara McClintock §Nobelpreis)
TEM-Aufnahme zweier Virionen von Alteromonas-Myovirus V22.
Rekonstruktion des doppelschaligen gesprenkelten Kapsids des Salmonella-Phagen SPN3US,[51] Gattung SeoulvirusMikrophotographie von Phage SPN3US mit DNA-gefülltem Kopf und kontrahiertem Schwanz.[51][A. 2]
Gattung Seoulvirus (früher Spn3virus), zu unterscheiden vom Seoul-Virus (Spezies Seoul orthohantavirus, Gattung Orthohantavirus)
Spezies Salmonella-Virus SPN3US (wiss. Seoulvirus SPN3US), mit Salmonella-Phage SPN3US[51][29]
Gattung Serwervirus
Spezies Pseudomonas-Virus 201phi21 (wiss. Serwervirus 201phi21), mit Pseudomonas phage 201phi2-1 alias Pseudomonas chlororaphis phage 201phi2-1 (201φ2-1)[52][53][54] – früher zu Phikzvirus[35]
↑ abDas Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.
Literatur
A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (Hrsg.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 46–62.
C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego 2004.
C. M. Mizuno, F. Rodriguez-Valera, N. E. Kimes, R. Ghai: Expanding the Marine Virosphere Using Metagenomics. In: PLoS Genetics. 9. Jahrgang, Nr.12, 2013, S.e1003987, doi:10.1371/journal.pgen.1003987, PMID 24348267, PMC 3861242 (freier Volltext) – (englisch).
Weblinks
Bildergalerie der Familie Myoviridae. Big Picture Book of Viruses
Karthik Chamakura: How does the energy for contraction get built into the tails of myophages? Research Projekt at Texas A&M University AgriLife Research. Center for Phage Technology.
Einzelnachweise
↑ abc ICTV: ICTV Master Species List 2021.v1, New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37)
↑ Antje Wichels, Stefan S. Biel, Hans R. Gelderblom, Thorsten Brinkhoff, Gerard Muyzer, Christian Schütt: Bacteriophage diversity in the North Sea. In: Applied and Environmental Microbiology, Band 64, Nr. 11, November 1998, S. 4128-4133; doi:10.1128/AEM.64.11.4128-4133.1998, PMID 9797256, PMC 106618 (freier Volltext), PDF (englisch).
↑ ab Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy. In: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
↑ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
↑Y. Liu et al. (ICTV Archaeal Viruses Subcommittee): Proposal 2021.001A (zip:docx), PDF (via Universität Helsinki). Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020. Siehe insbes. Tbl. 1.
↑ C. Lood, R. Lavigne, D. Turner, C. Moraru, E. M. Adriaenssens, A. M. Kropinski, Z. Drulis-Kawa: Proposal 2022.006B Create a new family (Arenbergviridae) and a new genus (Wroclawvirus) with a single species (Caudoviricetes). Oktober 2020.
↑ Enea Maffei, Anne-Kathrin Woischnig, Marco R. Burkolter, Yannik Heyer, Dorentina Humolli, Nicole Thürkauf, Thomas Bock, Alexander Schmidt, Pablo Manfredi, Adrian Egli, Nina Khanna, Urs Jenal, Alexander Harms: Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells of Pseudomonas aeruginosa by direct lytic replication. In: Nature Communications, Band 15, Nr. 175, 2. Januar 2024; doi:10.1038/s41467-023-44157-3 (englisch). Dazu:
David Nield: Virus That Murders Sleeping Bacteria Could Be Used to Assassinate Superbugs. Auf: sciencealert vom 30. Januar 2024.
Martin Vieweg: „Bakterien-Fresser“ mit Potenzial entdeckt. Auf: wissenschaft.de vom 22. Januar 2024.
↑ ab Evelien M. Adriaenssens, Mart Krupovic et al.: Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018–2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee. In: Archives of Virology, 165, 11. März 2020, S. 1253–1260, doi:10.1007/s00705-020-04577-8, PDF (PDF)
↑ abL. Truncaite, E. Šimoliūnas, A. Zajančkauskaite, L. Kaliniene, R. Mankevičiūte, J. Staniulis, V. Klausa, R. Meškys: Bacteriophage vB_EcoM_FV3: A new member of "rV5-like viruses". In: Archives of Virology. 157. Jahrgang, Nr.12, 2012, S.2431–2435, doi:10.1007/s00705-012-1449-x, PMID 22907825 (englisch).
↑S. B. Santos, A. M. Kropinski, P.-J. Ceyssens, H.-W. Ackermann, A. Villegas, R. Lavigne, V. N. Krylov, C. M. Carvalho, E. C. Ferreira, J. Azeredo: Genomic and Proteomic Characterization of the Broad-Host-Range Salmonella Phage PVP-SE1: Creation of a New Phage Genus. In: Journal of Virology. 85. Jahrgang, Nr.21, 2011, S.11265–11273, doi:10.1128/JVI.01769-10, PMID 21865376, PMC 3194984 (freier Volltext) – (englisch).
↑ abcdefgh André M. Comeau, Denise Tremblay, Sylvain Moineau, Thomas Rattei, Alla I. Kushkina, Fedor I. Tovkach, Henry M. Krisch, Hans-Wolfgang Ackermann: Phage Morphology Recapitulates Phylogeny: The Comparative Genomics of a New Group of Myoviruses. In: PLOS ONE, Band 7, Nr. 7, 6. Juli 2012, S. e40102; doi:10.1371/journal.pone.0040102.
↑ Melissa B. Duhaime, Natalie Solonenko, Simon Roux, Nathan C. Verberkmoes, Antje Wichels, Matthew B. Sullivan: Comparative Omics and Trait Analyses of Marine Pseudoalteromonas Phages Advance the Phage OTU Concept. In: Frontiers in Microbiology, Band 8, Sec. Virology, 6. Juli 2017, S. 1241; doi:10.3389/fmicb.2017.01241, PMID 28729861, PMC 5498523 (freier Volltext) (englisch). Siehe insbes. Tbl. 2.
↑ Grégory Resch, Eva M. Kulik, Fred S. Dietrich, Jürg Meyer: Complete Genomic Nucleotide Sequence of the Temperate Bacteriophage AaΦ23 of Actinobacillus actinomycetemcomitans. In: ASM Journals: Journal of Bacteriology, Band 186, Nr. 16, 15. August 2004, S. 5523–5528; doi:10.1128/JB.186.16.5523-5528.2004, PMC 490939 (freier Volltext), PMID 15292156.
↑Eunsu Ha, Bokyung Son, Sangryeol Ryu: Clostridium perfringens Virulent Bacteriophage CPS2 and Its Thermostable Endolysin LysCPS2. In: MDPI Viruses, Band 10, Nr. 5, Special Issue Biotechnological Applications of Phage and Phage-Derived Proteins, 251, 11. Mai 2018, doi:10.3390/v10050251
↑ abc Victor Krylov, Maria Bourkaltseva, Elena Pleteneva, Olga Shaburova, Sergey Krylov, Alexander Karaulov, Sergey Zhavoronok, Oxana Svitich, Vitaly Zverev: Phage phiKZ—The First of Giants. In: Viruses. Band13, Nr.2. MDPI, 20. Januar 2021, 149, doi:10.3390/v13020149 (englisch).
↑ abc Victor Krylov, Olga Shaburova, Sergey Krylov, Elena Pleteneva: A Genetic Approach to the Development of New Therapeutic Phages to Fight Pseudomonas Aeruginosa in Wound Infections. In: MDPI Viruses, Band 5, Nr. 1, 21. Dezember 2012, Special Issue Recent Progress in Bacteriophage Research, S. 15–53, doi:10.3390/v5010015
↑ Marcel Sprenger, Malte Siemers, Sebastian Krautwurst, Kai Papenfort: Small RNAs direct attack and defense mechanisms in a quorum sensing phage and its host. In: Cell Host & Microbe, 4. April 2024; doi:10.1016/j.chom.2024.03.010 (englisch). Dazu:
Attack and defence in the microverse. How small RNA molecules regulate viral infections of bacteria. Auf: EurekAlert! vom 4. April 2024. Quelle: Friedrich-Schiller-Universität Jena.
↑ abJun Kwon et al.: Isolation and Characterization of Salmonella Jumbo-Phage pSal-SNUABM-04. In: Viruses, Band 13, Nr. 1, Giant or Jumbo Phages, 27, 25. Dezember 2020, doi:10.3390/v13010027.
↑Mart Krupovic, Anja Spang, Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre, Christa Schleper: A thaumarchaeal provirus testifies for an ancient association of tailed viruses with archaea. In: Biochem Soc Trans, Band 39, Nr. 1, Januar 2011, s. 82–88, doi:10.1042/BST0390082, PMID 21265751, ResearchGate
↑ ab Xuewei Pan, Xiaoli Cui, Fenjiao Zhang, Yang He, Lingyan Li, Hongjiang Yang: Genetic Evidence for O-Specific Antigen as Receptor of Pseudomonas aeruginosa Phage K8 and Its Genomic Analysis. In: Front. Microbiol., 2. März 2016; doi:10.3389/fmicb.2016.00252.
↑ Ramon Sanchez-Rosario, Jesus Garcia, Vivian Rodriguez, Kevin A. Schug, Zacariah L. Hildenbrand, Ricardo A. Bernal: Using Bacteriophages to Treat Resilient Bacteria Found in Produced Water. In: MDPI Water, Band 16, Nr. 6; 7. März 2024; doi:10.3390/w16060797 (englisch). Dazu:
A virus could help save billions of gallons of wastewater produced by fracking . Auf: EurekAlert! vom 30. April 2024.
↑ abA. Cornelissen, S. C. Hardies, O. V. Shaburova, V. N. Krylov, W. Mattheus, A. M. Kropinski, R. Lavigne: Complete Genome Sequence of the Giant Virus OBP and Comparative Genome Analysis of the Diverse KZ-Related Phages. In: Journal of Virology. 86. Jahrgang, Nr.3, 2011, S.1844–1852, doi:10.1128/JVI.06330-11, PMID 22130535, PMC 3264338 (freier Volltext) – (englisch).
↑Katherine S. Wetzel, Haley G. Aull, Kira M. Zack, Rebecca A. Garlena, Graham F. Hatfull: Protein-Mediated and RNA-Based Origins of Replication of Extrachromosomal Mycobacterial Prophages. In: mBio, Band 11, Nr. 2, März/April 2020, e00385-20; doi:10.1128/mBio.00385-20, PMC 7157519 (freier Volltext), PMID 32209683, Epub 24. März 2020.
↑ abcd Ting Yan, Lu Liang, Ping Yin, Yang Zhou, Ashraf Mahdy Sharoba, Qun Lu, Xingxing Dong, Kun Liu, Ian F. Connerton, Jinquan Li: Application of a Novel Phage LPSEYT for Biological Control of Salmonella in Foods. In: MDPI Microorganisms, Band 8, Nr. 3, Section Microbial Biotechnology, 400; doi:10.3390/microorganisms8030400
↑ abc J. Bernard Heymann et al.: The Mottled Capsid of the Salmonella Giant Phage SPN3US, a Likely Maturation Intermediate with a Novel Internal Shell. In: Viruses, Band 12, Nr. 9, 910, 19. August 2020, doi:10.3390/v12090910.
↑ Matthew Dunne, Mario Hupfeld, Jochen Klumpp, Martin J. Loessner: Molecular Basis of Bacterial Host Interactions by Gram-Positive Targeting Bacteriophages, in: MDPI Viruses, Band 10, Nr. 8, Special Issue Phage-Host Interactions, 397, 28. Juli 2018, doi:10.3390/v10080397. Anm.: Der Baillus-Phage PBS1 hat keine Siphoviren-Morphologie, sondern hat die Gestalt der Myoviren (Spezies Takahashivirus PBS1). Pecentumvirus A511 (früher Myovirus A511, mit Listeria-Phage A511) wurde vom ICTV zu den Herelleviridae verschoben.
↑K. Holmfeldt, N. Solonenko, M. Shah, K. Corrier, L. Riemann, N. C. Verberkmoes, M. B. Sullivan: Twelve previously unknown phage genera are ubiquitous in global oceans. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 110. Jahrgang, Nr.31, 2013, S.12798–12803, doi:10.1073/pnas.1305956110, PMID 23858439, PMC 3732932 (freier Volltext) – (englisch). Siehe insbes. Supplement 1.
↑ abcd John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307, doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext); siehe Fig. 3 (Genomkarte)
↑ abC. Chénard, J. F. Wirth, C. A. Suttle: Viruses Infecting a freshwater filamentous cyanobacterium (Nostoc sp.) encode a functional CRISPR array and a proteobacterial DNA polymerase B. In: mBio. 7. Jahrgang, 14. Juni 2016, S.e00667–16, doi:10.1128/mBio.00667-16, PMID 27302758, PMC 4916379 (freier Volltext) – (englisch).
↑Przemyslaw Decewicz, Piotr Golec, Mateusz Szymczak, Monika Radlinska, Lukasz Dziewit: Identification and Characterization of the First Virulent Phages, Including a Novel Jumbo Virus, Infecting Ochrobactrum spp. In: MDPI Int. J. Mol. Sci, Band 21, Nr. 6, Special Issue Bacteriophage Molecular Studies, 18. März 2020, 2096; doi:10.3390/ijms21062096
↑Richard Allen White III, Curtis A. Suttle: The Draft Genome Sequence of Sphingomonas paucimobilis Strain HER1398 (Proteobacteria), Host to the Giant PAU Phage, Indicates That It Is a Member of the Genus Sphingobacterium (Bacteroidetes). In: Genome Announc. Band 1, Nr. 4, Juli-August 2013, S. e00598-13; doi:10.1128/genomeA.00598-13, PMID 23929486, PMC 3738902 (freier Volltext)
↑Natalia Bagińska, Anna Pichlak, Andrzej Górski1, Ewa Jończyk-Matysiak: Specific and Selective Bacteriophages in the Fight against Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii (PDF) in: Virologica Sinica, Band 34, S. 347–357; doi:10.1007/s12250-019-00125-0, Tbl. 1
↑Kaitlyn E. Kortright, Rachel E. Done, Benjamin K. Chan, Valeria Souza, Paul E. Turner: Selection for phage resistance reduces virulence of Shigella flexneri, in: ASM Appl. and Env. Microbiol. (AEM), 17. November 2021, doi:10.1128/AEM.01514-21. Dazu: Erin Garcia de Jesús: A bacteria-virus arms race could lead to a new way to treat shigellosis, auf: ScinceNews vom 14. Dezember 2021.
↑Basem Al-Shayeb, Rohan Sachdeva, L. Chen, Jillian F. Banfield et al.: Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems. In: Nature, 12. Februar 2020, doi:10.1038/s41586-020-2007-4
↑Ed Yong: A Huge Discovery in the World of Viruses. The Atlantic, 20. Februar 2020
↑Audra E. Devoto, Joanne M. Santini et al.: Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes. In: Nature Microbiology, Band 4, S. 693–700, 28. Januar 2019, doi:10.1038/s41564-018-0338-9, insbes. Tabelle 1 und Supplementary Figure 11.